KingFisher 全自动核酸提取仪样品数据

鼻咽拭子样本使用 250 copies/mL（左）或 750 copies/mL（右）（分别为检测限的 1 倍或 3 倍）的 SARS-CoV-2 病毒 RNA 进行加标；使用 MagMAX 病毒/病原体试剂盒从 200 μL 或 400 μL 的加标样品中分3次提取 RNA，试剂盒（货号 A42352）带（+）或不带（-）洗涤 3 步骤。以 50 μL 洗脱后，通过 qRT-PCR 对四个 RNA 靶标（彩色符号）进行 3 次重复测定。每个靶标的 C_t 值高度一致（紧密符号簇），并且在各种样品量和洗涤条件之间几乎完全相同，从而使简化的低样品量方案得到了验证。所有阴性样品均具有“未检测到”的 C_t 值（数据未显示）。

使用 MagMAX 多样品 Ultra 2.0 试剂盒（货号 A36570），通过 KingFisher Duo Prime 从两个供体的全血中分离 DNA。使用大体积方案在 24 孔板中处理 >400 µL 样品，而使用小体积方案在 96 孔板中处理 50–400 µL 样品。（即使在同一板上同时运行 50 µL 和 400 µL 样品，也无需对样品体积进行归一化处理。）运行时间为 45 分钟。（顶部）无论是小体积还是大体积起始样品，回收量都是线性的。（底部）A₂₆₀/A₂₈₀ 和 A₂₆₀/A₂₃₀ 比值证明不同样品体积都具有高纯度。

在 KingFisher Flex 上使用 MagMAX 微生物组 Ultra 核酸分离试剂盒（货号 A42357 和 A42358）从两个供体的粪便、尿液和唾液样品中分离的总核酸，进行鸟枪法宏基因组测序并与已知微生物谱进行比较。图中显示了所有样本的特定微生物群的丰度热图。结果证实，每个人体微生物群都具有不同的显性特征分类群，只有少数几个共有的种类，主要在尿液和唾液之间。在每个社区，供体之间存在着很大的重叠，但也有明显的个体差异。