初次生成特定生物体的原始基因序列的过程,称为从头测序。对于任何生物体,只有进行过从头测序后,才可能进行详细的基因分析。
从头测序通常伴随着如下过程,将单独的序列读段装配成更长的连续序列(邻接片段),在缺少参照序列的情况下装配成正确排序的邻接片段(支架)。
从头测序方法
传统的做法是,采用毛细管电泳 (CE) 测序仪进行从头测序。CE 测序法具有较长的读长和较高的精确度,这也使得重叠保守序列装配成为从头装配项目的金标准。但在最近,随着大规模并行测序的高通量能力提高和短读长装配程序的出现,整个基因组测序相关的时间和成本支出已经大幅降低。
使用 SOLiD 新一代测序进行从头测序
- 出色覆盖度—通量高达 30 Gb /天以上,可为您的基因组装配带来所需的覆盖度
- 更高的置信度—Exact Call 化学试剂可提供高达 99.99% 的精确度,可让您在更低覆盖度下完成可信度更高的装配
- 灵活的装配程序选择—可以选择碱基间距和彩色间距输出,让您可以自由选用装配程序
新一代测序的从头测序样本制备
从头测序可获得之前无法获得的特定生物体原始基因序列。 为了更详细地分析某个生物体的基因信息,必须要首先进行从头测序。 由于采用传统测序方法测序生物体费时费力,新一代测序技术的功能推进了从头测序工作进程。
使用 Sanger 测序法进行从头测序
- 可获得更长的序列支架—长读长和精确性,使您可以通过重叠保守序列装配获得较长的序列支架
- 精确、可靠的检测—更高的光学灵敏度和先进的聚合物,可帮助您以更低的成本获得更高质量的数据
- 自动化方法—超过 24 小时无需值守的运行;多项自动化功能,可减少人为错误来源
- 结果可重复性—优化的聚合物,在不影响相关结果的前提下,提高了生产效率
Visistat reference component
仅供科研使用,不可用于诊断目的。