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对照图 1.Silencer Select siRNA 设计算法显著提高了有效的 siRNA 预测准确度。 Silencer Select siRNA 设计算法用于针对 40 个不同的靶标设计 155 种 siRNAs。在 HeLa 细胞中使用这些 siRNAs 与旧版算法设计的siRNAs 进行平行测试。在转染后 48 小时使用 TaqMan 基因表达检测实验通过 qRT-PCR 测量 mRNA 敲低效果。结果表示为 Silencer Negative Control #1 siRNA 处理的细胞的 mRNA 表达量的百分比。插图显示了≥70% 和≥80% mRNA 敲低效果的 siRNAs 的百分比。
- 集成了最新改良的siRNA设计、脱靶效应预测算法和化学修饰方法
- 具有无与伦比的沉默一致性、效力和特异性
- 由于沉默效果不佳而导致实验失败结果的次数大大减少
- 生成更为清晰和稳定的表型数据
- 升级：siRNA实验假阳性和假阴性结果大大减少
Silencer Select siRNAs具有以下四大优势：
- 高沉默效率 - 沉默效率最高可达其它siRNAs的100倍
- 高特异性 - 锁核酸修饰最多可减少90% 的脱靶效应
- 高可信度 - 被广泛证明的表型结果一致性
- 高保障 - 100% 保证沉默效率，业内最高保障
对靶向长非编码 RNA 感兴趣？了解更多关于靶向 lncRNA 的 siRNA或在下面搜索您感兴趣的 lncRNA 基因。
订购您的 Silencer Select siRNA 阳性和阴性对照
使用 Silencer Select siRNA 进行靶向基因沉默
Silencer Select 设计算法
- 包含>90 种不同的序列和热力学参数
- 与上一代 siRNA 设计算法相比，预测准确性提高 28%
- 给出的 siRNAs 沉默效率比其他供应商的修饰和未修饰 siRNAs 高达100 倍
- 与其他 siRNA 相比，在靶编辑百分比显著提高
大多数 siRNA 设计算法给出的siRNAs，仅能以约 80% 的置信度 预测70% 的靶向 mRNA 沉默效率，而无法给出更有效的 siRNAs。许多 RNAi 应用需要的沉默效率高于当前算法提供的效率。因此，我们使用强大的机器学习方法和来自数千个 siRNA 的性能数据来更好地了解 siRNA 的序列、靶标位置和热力学特性及其沉默效率之间的联系。 Silencer Select siRNA 设计算法油然而生。
增强特异性以减少脱靶效应
序列特异性脱靶效应是 RNAi 实验中出现假阳性结果的主要原因之一。除了 Silencer Select 算法和最先进的生物信息学筛选标准提供的效力改进之外，Silencer Select siRNA 还结合了经证实可提高 siRNA 特异性的修饰技术。
Silencer Select siRNAs 中的化学修饰：
- 持续增强引导链 (反义链) 偏向性，这已被证明与沉默效率密切相关
- 防止过客链 (正义链) 诱导沉默，这有助于减少脱靶效应
- 与未修饰的 siRNA 相比，将基因表达阵列检测到的非靶向、差异表达基因的数量减少多达 90%
- 不会对沉默效率产生负面影响，因此不会影响预期的表型
- 产生更清晰、更一致的细胞生物学数据
图 2.Silencer Select siRNA 修饰可减少脱靶效应并产生更可靠的表型数据。53 种不同的 siRNAs，包括以前指出会引发脱靶效应的旧设计，以 30 nM 的浓度将未修饰和 Silencer Select 修饰的 siRNAs 转染到 U2OS 细胞中。48小时后测量有丝分裂和细胞凋亡。数据以阴性对照 siRNA 转染细胞为对比展示。黑色 = 与对照相似的有丝分裂/凋亡水平。绿色 = 下调。红色 = 上调。请注意，修饰未改变 PLK 和 WEE1 siRNAs 的预期有丝分裂和凋亡表型。相反，通过添加 Silencer Select 修饰消除了 10 个未修饰 siRNAs 介导的脱靶凋亡表型。
图 3.Silencer Select siRNA 修饰可减少差异表达的脱靶基因的数量。三个带有和不带有 Silencer Select 修饰的阴性对照 siRNA 分别以 30 nM 浓度转染到 HeLa 细胞中。在 Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array 上提取和分析 RNA，共进行三次。y 轴表示差异表达基因的平均数量——与模拟转染样品相比，表达变化≥2 倍的基因。
100 % 保证 – 业内最佳
在 Thermo Fisher Scientific，我们保证当您购买两个 Invitrogen Silencer Select 预先设计的针对同一靶标的 siRNA 时，这两个 siRNAs 将使靶标 mRNA 沉默 70% 或更多。要获得保证，siRNA 必须在 ≥5 nM 浓度下转染，并且在转染后 48 小时检测 mRNA 水平。点击链接了解更多关于我们行业领先的保证的条款。
经过 Silencer Select 验证的 siRNA
针对人类靶标的一部分 Invitrogen siRNAs 已在内部进行了功能测试，并经验证可将靶标 mRNA 水平降低 70% 或更多，使我们能够保证这些经过 Silencer Select 验证的 siRNAs 将沉默其靶标基因。这些 siRNA 的数据表展示了在测试期间观察到的 mRNA 敲低程度以及 siRNA 靶向的外显子。对于大多数类型，还免费提供完整的序列信息。
免费获取 Silencer Select siRNA 序列和相关数据
近年来，siRNA 筛选突出了该技术的问题，这些问题源于脱靶效应、不稳定的沉默效率以及筛选结果的低水平置信度。
美国国立卫生研究院的研究人员在《自然》杂志上发表的全基因组筛选文章强调了一种有效的方法来规避筛选研究目前面临的挑战。本文献重点介绍了从种子区域产生的假阳性中筛选获取真阳性的新生物信息学技术。种子序列驱动的脱靶效应已在 siRNA 筛选中广泛观察到，因为它们源于种子驱动的 mRNA 调节的内源性 miRNA 机制。这项开创性的工作突出了作为单个排列的在较低 siRNA 浓度下使用高效 Silencer Select siRNA，从而可以识别源自种子序列的脱靶（假阳性或假阴性）。这种解卷积不能用于混合型 siRNA 筛选 (由于两个或多个 siRNA 以协同方式工作，因此可以观察到独特的生物学特性)。
国家科学转化促进中心 (NCATS) 和 Thermo Fisher Scientific 为所有研究人员提供了从人类全基因组 Silencer Select siRNA 文库中获取 siRNA 序列和 PubChem 相关数据的途径，该文库包括针对 20,000 多个人类基因的 65,000 条 siRNA 序列。
通过搜索特定的 siRNA 检测 ID，访问存储在NCBI PubChem 物质数据库中的 siRNA 序列 。
高质量的 RNA 合成
我们在经过 ISO13485 和 ISO9001 认证的最先进设施中合成和纯化每条 siRNA，以满足最高质量标准。作为我们严格质量控制程序的一部分，每个 RNA 寡核苷酸都通过 LCMS 和/或分析型 HPLC 进行分析。结果是被纯化并可以直接使用的优质 siRNA 。
近似的工艺周期*
| 标准纯化 | 4个工作日 |
| 高效液相色谱纯化 | 6 个工作日（20 和 40 nmol） 8个工作日（160 nmol） |
| 体内准备就绪 | 12 个工作日（100 和 250 nmol） 15个工作日（1 µmol） 20个工作日（10 µmol） |
| Cy3 和 FAM 标签 | 8个工作日 |
*从订单确认到从加利福尼亚州普莱森顿发货的预计时间，订单将在太平洋标准时间下午 2 点之前确认。不包括运送所需的时间（美国和加拿大运送通常是隔夜，欧洲需要 2 天，其他地方需要 2-3 天）。
Silencer Select 设计算法
- 包含>90 种不同的序列和热力学参数
- 与上一代 siRNA 设计算法相比，预测准确性提高 28%
- 给出的 siRNAs 沉默效率比其他供应商的修饰和未修饰 siRNAs 高达100 倍
- 与其他 siRNA 相比，在靶编辑百分比显著提高
大多数 siRNA 设计算法给出的siRNAs，仅能以约 80% 的置信度 预测70% 的靶向 mRNA 沉默效率，而无法给出更有效的 siRNAs。许多 RNAi 应用需要的沉默效率高于当前算法提供的效率。因此，我们使用强大的机器学习方法和来自数千个 siRNA 的性能数据来更好地了解 siRNA 的序列、靶标位置和热力学特性及其沉默效率之间的联系。 Silencer Select siRNA 设计算法油然而生。
图 1.Silencer Select siRNA 设计算法显著提高了有效的 siRNA 预测准确度。 Silencer Select siRNA 设计算法用于针对 40 个不同的靶标设计 155 种 siRNAs。在 HeLa 细胞中使用这些 siRNAs 与旧版算法设计的siRNAs 进行平行测试。在转染后 48 小时使用 TaqMan 基因表达检测实验通过 qRT-PCR 测量 mRNA 敲低效果。结果表示为 Silencer Negative Control #1 siRNA 处理的细胞的 mRNA 表达量的百分比。插图显示了≥70% 和≥80% mRNA 敲低效果的 siRNAs 的百分比。
增强特异性以减少脱靶效应
序列特异性脱靶效应是 RNAi 实验中出现假阳性结果的主要原因之一。除了 Silencer Select 算法和最先进的生物信息学筛选标准提供的效力改进之外，Silencer Select siRNA 还结合了经证实可提高 siRNA 特异性的修饰技术。
Silencer Select siRNAs 中的化学修饰：
- 持续增强引导链 (反义链) 偏向性，这已被证明与沉默效率密切相关
- 防止过客链 (正义链) 诱导沉默，这有助于减少脱靶效应
- 与未修饰的 siRNA 相比，将基因表达阵列检测到的非靶向、差异表达基因的数量减少多达 90%
- 不会对沉默效率产生负面影响，因此不会影响预期的表型
- 产生更清晰、更一致的细胞生物学数据
图 2.Silencer Select siRNA 修饰可减少脱靶效应并产生更可靠的表型数据。53 种不同的 siRNAs，包括以前指出会引发脱靶效应的旧设计，以 30 nM 的浓度将未修饰和 Silencer Select 修饰的 siRNAs 转染到 U2OS 细胞中。48小时后测量有丝分裂和细胞凋亡。数据以阴性对照 siRNA 转染细胞为对比展示。黑色 = 与对照相似的有丝分裂/凋亡水平。绿色 = 下调。红色 = 上调。请注意，修饰未改变 PLK 和 WEE1 siRNAs 的预期有丝分裂和凋亡表型。相反，通过添加 Silencer Select 修饰消除了 10 个未修饰 siRNAs 介导的脱靶凋亡表型。
图 3.Silencer Select siRNA 修饰可减少差异表达的脱靶基因的数量。三个带有和不带有 Silencer Select 修饰的阴性对照 siRNA 分别以 30 nM 浓度转染到 HeLa 细胞中。在 Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array 上提取和分析 RNA，共进行三次。y 轴表示差异表达基因的平均数量——与模拟转染样品相比，表达变化≥2 倍的基因。
100 % 保证 – 业内最佳
在 Thermo Fisher Scientific，我们保证当您购买两个 Invitrogen Silencer Select 预先设计的针对同一靶标的 siRNA 时，这两个 siRNAs 将使靶标 mRNA 沉默 70% 或更多。要获得保证，siRNA 必须在 ≥5 nM 浓度下转染，并且在转染后 48 小时检测 mRNA 水平。点击链接了解更多关于我们行业领先的保证的条款。
经过 Silencer Select 验证的 siRNA
针对人类靶标的一部分 Invitrogen siRNAs 已在内部进行了功能测试，并经验证可将靶标 mRNA 水平降低 70% 或更多，使我们能够保证这些经过 Silencer Select 验证的 siRNAs 将沉默其靶标基因。这些 siRNA 的数据表展示了在测试期间观察到的 mRNA 敲低程度以及 siRNA 靶向的外显子。对于大多数类型，还免费提供完整的序列信息。
免费获取 Silencer Select siRNA 序列和相关数据
近年来，siRNA 筛选突出了该技术的问题，这些问题源于脱靶效应、不稳定的沉默效率以及筛选结果的低水平置信度。
美国国立卫生研究院的研究人员在《自然》杂志上发表的全基因组筛选文章强调了一种有效的方法来规避筛选研究目前面临的挑战。本文献重点介绍了从种子区域产生的假阳性中筛选获取真阳性的新生物信息学技术。种子序列驱动的脱靶效应已在 siRNA 筛选中广泛观察到，因为它们源于种子驱动的 mRNA 调节的内源性 miRNA 机制。这项开创性的工作突出了作为单个排列的在较低 siRNA 浓度下使用高效 Silencer Select siRNA，从而可以识别源自种子序列的脱靶（假阳性或假阴性）。这种解卷积不能用于混合型 siRNA 筛选 (由于两个或多个 siRNA 以协同方式工作，因此可以观察到独特的生物学特性)。
国家科学转化促进中心 (NCATS) 和 Thermo Fisher Scientific 为所有研究人员提供了从人类全基因组 Silencer Select siRNA 文库中获取 siRNA 序列和 PubChem 相关数据的途径，该文库包括针对 20,000 多个人类基因的 65,000 条 siRNA 序列。
通过搜索特定的 siRNA 检测 ID，访问存储在NCBI PubChem 物质数据库中的 siRNA 序列 。
高质量的 RNA 合成
我们在经过 ISO13485 和 ISO9001 认证的最先进设施中合成和纯化每条 siRNA，以满足最高质量标准。作为我们严格质量控制程序的一部分，每个 RNA 寡核苷酸都通过 LCMS 和/或分析型 HPLC 进行分析。结果是被纯化并可以直接使用的优质 siRNA 。
近似的工艺周期*
| 标准纯化 | 4个工作日 |
| 高效液相色谱纯化 | 6 个工作日（20 和 40 nmol） 8个工作日（160 nmol） |
| 体内准备就绪 | 12 个工作日（100 和 250 nmol） 15个工作日（1 µmol） 20个工作日（10 µmol） |
| Cy3 和 FAM 标签 | 8个工作日 |
*从订单确认到从加利福尼亚州普莱森顿发货的预计时间，订单将在太平洋标准时间下午 2 点之前确认。不包括运送所需的时间（美国和加拿大运送通常是隔夜，欧洲需要 2 天，其他地方需要 2-3 天）。
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支持
如果您对产品或订购有任何疑问，请通过 RNAiSupport@thermofisher.com联系我们
有关 siRNA 实验或结果的问题，请通过TechServices@thermofisher.com联系技术应用科学家
对照品
文库
100%保证 — 业内最佳
我们保证，购买针对同一靶标基因预设计两条Silencer Select siRNA，这两种siRNA将会沉默70%以上的靶标mRNA。为确保该担保效果，必须转染5 nM以上的siRNA且须在转染后48小时检测mRNA水平。建议使用Real-Time RT-PCR，但不做硬性规定。用户还必须使用阳性对照siRNA证明敲低率高于80%，从而验证转染效率。如未观察到担保的敲低率水平且使用合适的阳性对照获得成功结果，我们将免费更换最多两份全新Silencer Select siRNA设计。该担保不适用于任何更换的产品。
减少siRNA实验的假阳性和假阴性结果
（获取Ambion siRNA序列和相关数据）
近年来，siRNA筛选出现了脱靶效应、敲低效力水平不等以及筛选命中率低等突出技术问题。
美国国家卫生研究院最近在《自然》杂志上发表的一项全基因组筛选研究，揭示了一种可规避当前筛选技术问题的有效方法。该文章特别6指出了一种新型生物信息学技术，可从来自于种子序列的假阳性结果解读真阳性结果。在siRNA筛选中已广泛观察到种子序列导致的脱靶效应，因为这些来自于miRNA驱动种子序列。这项重要工作突出表明了使用低siRNA浓度的高效率SilencerSelect siRNA进行阵列检测，能够鉴定来自于种子序列的脱靶效应（假阳性或假阴性）。混合方法无法实现这种去卷积效果，但能观察到由两个或更多siRNA共同发挥作用产生的独特生物学效应。
美国国家转化科学促进中心(NCATS)和赛默飞世尔科技还通过PubChem将访问权限开通给研究人员，研究人员可藉此访问Life Technologies Silencer Select siRNA文库siRNA序列及相关数据，了解靶向20000多个人类基因的65000 个siRNA序列的信息。
点击此处阅读研究文章
点击此处获取siRNA序列
更换上述产品是赛默飞世尔科技的唯一责任，同时也是客户可就上述担保获得的唯一补偿。如需安排更换产品，请联系技术服务部。请备好证明转染效率和mRNA敲低测量结果的数据。如需更换，请联系技术支持。
仅供科研使用，不可用于诊断目的。