CRISPR 文库，适用于功能基因组筛选
您可以使用 CRISPR 筛选对相关基因集或定制集合进行集中的功能缺失分析，或者自信地进行全基因组 CRISPR 的无偏差筛选。
使用 LentiArray 和 LentiPool gRNA 文库进行 CRISPR 筛选
使用慢病毒 gRNA 文库提高您的 CRISPR 筛选能力。慢病毒文库可同时对数百个基因轻松进行 CRISPR 基因编辑。我们曾获奖的 Invitrogen LentiArray 和 LentiPool CRISPR 文库采用先进的 gRNA 设计，在保持特异性的同时提高敲除效率。
慢病毒文库形式
LentiArray CRISPR 文库
以阵列板形式提供，每孔含一个基因靶点（可多达 4 个 gRNAs）。与高通量筛选平台相容。
LentiPool CRISPR 文库
将不同 gRNA 慢病毒在一个管中混合。无需高通量基础设施即可进行 CRISPR-Cas9 筛选。
CRISPR 文库使用我们的专有 gRNA 设计算法构建，整合了最新的研究成果和我们广泛的内部经验。选择的 gRNA 设计提高了敲除效率，同时不影响特异性。对于每个基因靶点，我们提供了多达 4 个高质量的 gRNA，以帮助确保慢病毒文库可以在多种细胞类型中实现高效的靶基因敲除。
使用 LentiArray CRISPR 文库进行高通量阵列式 CRISPR 筛选
LentiArray CRISPR 文库在 96 孔板中以阵列形式提供，与高通量筛选平台相容。这些慢病毒库提供了一个灵活的系统，不会对您的功能基因组学检测设计或研究目标施加限制。
数据：LentiArray CRISPR 文库可对大多数靶基因实现高效基因编辑
图 1.LentiArray CRISPR 文库 gRNA 可对大部分靶基因实现高效编辑。(A) 用针对 LentiArray 人类癌症生物学 CRISPR 文库中一组基因的阵列式 LentiArray gRNA 慢病毒颗粒转导稳定表达 Cas9 的 HT1080 细胞。NGS 分析结果显示，87% 的靶基因敲除效率为 >50%（红线），77% 的靶基因敲除效率为 >70%（紫线）。(B) 用单个慢病毒 gRNAs 转导稳定表达 Cas9 的 U87MG 和 A431 细胞，然后使用抗相应靶基因的特异性抗体收获细胞，进行免疫印迹分析。没有检测到AKT、PIK3R1 和 EGFR蛋白，表明该方法可以有效敲除蛋白。
使用 LentiPool CRISPR 文库进行经济实惠的筛选
LentiPool CRISPR 文库无需高通量基础设施即可进行 CRISPR-Cas9 筛选。这些高质量的混合慢病毒文库涵盖与我们的 LentiArray 文库相同的基因靶点，以即用型高滴度（>1 × 10 8 TU/mL）慢病毒颗粒的形式提供，用于影响更高的基因敲除筛选。
LentiPool CRISPR 文库包括为每个靶向基因编码多达四个 gRNA 的慢病毒，并在一个管中混合。所有实验均可使用新一代测序 (NGS) 进行。我们的 LentiPool 文库通过 NGS 进行质量控制，以确认 gRNA 和基因编码。
混合 CRISPR 文库筛选工作流程
 | 生成表达 Cas9 的细胞：
|
 | 用混合 sgRNA 文库转导
|
 | 采用阳性或阴性选择进行初步筛选：
|
 | 通过 NGS 识别结果通过高通量测序分析基因组 DNA 的富集[阳性选择 (+)]或耗竭[阴性选择 (-)] sgRNA |
图 2.慢病毒混合筛选工作流程。使用 LentiArray 慢病毒 Cas9 核酸酶选择杀稻瘟素抗性，生成表达 Cas9 的稳定细胞系。然后，以适当的 MOI 值用 LentiPool sgRNA 文库转导这些 Cas9 表达细胞，并进行嘌呤霉素抗性选择。然后对转导的细胞群施加选择性压力或处理，如药物或化学扰动物质。分离基因组 DNA 并通过 PCR 技术扩增 sgRNA 插入片段。最后，对扩增子进行测序，以确定处理后哪些基因发生了富集/耗竭。
CRISPR 筛选的阳性、阴性和递送对照
高质量的对照对于高通量筛选的成功开发和卓越性能有着不可或缺的作用。不要忘记订购对照，以帮助您优化递送条件，最大限度地提高编辑效率，并建立结果选择标准。
针对 LentiArray CRISPR 文库，我们提供一系列阴性或阳性递送对照方案，可以带有或不带有表达 GFP 的构建体。GFP 标记可直观地读取数据，有助于快速优化病毒递送条件。
订购 LentiArray 和 LentiPool CRISPR 文库
这些 CRISPR 文库每个基因靶点包含多达 4 个 gRNAs，每个孔一个基因。慢病毒文库有两种形式可供选择：
- 每个基因靶点 100 μL （2 × 50 μL）即用型慢病毒颗粒，平均滴度为 1 × 108 TU/mL
- 每个 gRNA 提供 50 μL 的甘油菌，可用作存储库生成您自己的混合或阵列式文库。请注意，使用这种形式需要进行质粒制备和慢病毒包装。
预定义和定制的 CRISPR 文库均可用，从重点基因集到全基因组文库。我们的可成药基因组 CRISPR 文库旨在识别参与疾病发展和进展的潜在治疗靶点。
各 CRISPR 文库内的基因靶点是使用较新的基因组数据库（包括 NCBI RefSeq 数据库并交叉参考基因本体协会 (GO) 数据库和/或 HUGO 基因命名委员会 (HGNC)）进行选择的。随后，通过使用赛默飞世尔科技科学家开发的专有设计算法创建每个靶点的 gRNA 设计。
提供 CRISPR Cas9 筛选库
| CRISPR 文库和描述 | 基因 数* | gRNA 数* | LentiArray 形式 | |
|---|---|---|---|---|
| 即用型颗粒 | 甘油菌 | |||
| 全基因组 CRISPR 文库 专为全基因组 CRISPR 筛选设计，用于识别生物学通路和疾病发展中的新靶点。 | 18,392 | 73,568 | A42234 | A32167 |
| 可成药 CRISPR 基因组文库 专门用于识别参与疾病发展和进展的潜在治疗靶点。 | 10,132 | 40,512 | 查询 | A32184 |
| 激酶 CRISPR 文库 由于激酶参与许多信号级联以及其失调与疾病发展相关，因此激酶是一类主要的药物靶标。从 KinBase 数据库和其他资源中选择其他基因靶点。 | 822 | 3,288 | A42234 | A32167 |
| GPCR CRISPR 文库 作为许多生理和疾病进程的调控物质，G 蛋白偶联受体 (GPCR) 已成为最可成药的基因类别之一，且在 FDA 批准的药物中，有将近 30% 的药物靶向 GPCR。 | 446 | 1,784 | A42282 | A32183 |
| 癌症生物学 CRISPR 文库 靶向参与癌症发展的一些最常见的基因。在癌症基因组图谱 (TCGA) 中选择了其他基因靶点。 | 510 | 2,040 | A42268 | A32169 |
| 表观遗传学 CRISPR 文库 基因表达的表观遗传调控在正常发育中具有核心作用，被认为是许多疾病发展的促进因素。 | 396 | 1,548 | A42269 | A32170 |
| 泛素 CRISPR 文库 泛素系统通过控制蛋白质转化率维持细胞内稳态，其失调与癌症、病毒感染和神经退行性、肌肉骨骼、心血管和代谢疾病有关。 | 943 | 3,722 | A42270 | A32171 |
| 细胞周期 CRISPR 文库 细胞周期调节因子对于正常发育以及癌症和心血管、炎症和神经退行性疾病至关重要。靶点包括对于细胞周期进程至关重要的细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK)；细胞周期进程调节因子，如 CIP/KIP 家族蛋白和 INK4 细胞周期抑制剂；视网膜母细胞瘤家族蛋白；以及 DNA 复制因子，细胞分裂周期蛋白 (CDC)。 | 1,444 | 5,776 | A42271 | A32172 |
| 膜运输 CRISPR 文库 膜运输蛋白参与神经递质和内分泌释放、吞噬作用、内吞作用、自噬和其他过程。 | 141 | 564 | A42272 | A32173 |
| 转录因子 CRISPR 文库 转录因子是基因表达的关键调节子。 | 1,817 | 7,724 | A42273 | A32174 |
| 细胞核激素受体 CRISPR 文库 核激素受体是一类转录因子，可被类固醇激素、甲状腺激素、维生素 D 和维甲酸等脂溶性配体激活，调节代谢、发育、增殖、生殖和其他生物过程。 | 47 | 188 | A42274 | A32175 |
| 细胞凋亡 CRISPR 文库 细胞凋亡是一种受到严格调节的过程，对维持多细胞生物体中的稳态至关重要。细胞凋亡抑制可导致癌症、自身免疫和炎症疾病以及病毒感染，而过度激活可导致萎缩、组织损伤和神经退行性疾病。 | 904 | 3,616 | A42275 | A32176 |
| 药物转运蛋白 CRISPR 文库 转运蛋白在药理学中起关键作用，影响分子在细胞膜上的移动方式。 | 98 | 392 | A42276 | A32177 |
| 离子通道 CRISPR 文库 离子通道是一种整合膜蛋白，可建立产生静息膜电位和动作电位的电化学梯度。这些膜电位和电化学梯度对神经传导、心脏和肌肉收缩、胰腺胰岛素释放、T 细胞激活及其他进程至关重要。 | 328 | 1,312 | A42277 | A32178 |
| 细胞表面蛋白 CRISPR 文库 各类细胞表面蛋白允许细胞接收来自其环境的信息并对这些信息作出响应。 | 778 | 3,112 | A42278 | A32179 |
| 蛋白酶 CRISPR 文库 除了降解蛋白质，蛋白酶也是不可或缺的信号分子，蛋白酶信号通路的失调与心血管疾病、神经系统疾病、癌症和炎症性疾病有关。 | 475 | 1,900 | A42279 | A32180 |
| 肿瘤抑制因子 CRISPR 文库 肿瘤抑制因子是细胞周期进程的负调控因子，肿瘤抑制基因的丢失或突变常与癌症有关。其他靶点从肿瘤抑制基因数据库 (TSGene) 选择。 | 716 | 2,864 | A42280 | A32181 |
| DNA 损伤应答 CRISPR 文库 DNA 监测蛋白可持续检测 DNA 完整性并活化细胞周期检查点和 DNA 修复通路以响应 DNA 损伤。 | 561 | 2,244 | A42281 | A32182 |
| 磷酸酶 CRISPR 文库 可逆磷酸化是调节信号转导途径的核心。磷酸酶可使其靶蛋白去磷酸化，是信号转导通路调节的组成部分，也是潜在治疗靶点。 | 288 | 1,152 | A42267 | A32168 |
| 定制 CRISPR 文库 | 定制 | 定制 | 查询 | 查询 |
* 基因数和 gRNA 数可能会发生变化
CRISPR 文库的资源与支持
参考文献
新闻发布
用户指南
基因编辑资源和支持
资源
支持
仅供科研使用，不可用于诊断目的。