对未知小分子物质进行可靠鉴定
当没有可用的参考标准品时,可能需要质谱库和数据库来鉴定未知化合物。尤其对于代谢物组学、法医毒理学、食品 & 饮料、环境新兴污染物或者萃取物 & 溶出物等领域的研究而言。
在这些情况下,质谱库(特别是高分辨率、准确质量数 MSn 碎片谱库,如 mzCloud 质谱库)可提供可靠鉴定未知化合物所需的信息。
mzCloud 质谱库的主要优点
未知物质鉴定的可靠性 | 了解更多未知物质 | 从质谱数据获知结构信息 | 研究和常规应用的灵活性 |
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所有质谱库内容的全面整理,具有广泛、完全注释和可搜索的碎片谱库,为您的结果提供可靠性。 | 比对覆盖广泛化学空间的大量碎片质谱,利用自动反卷积和质谱库检索鉴定未知物质,包括小分子应用。 | 利用直接进样或 LC-MS进样、常规分辨或高分辨率数据的解决方案,即使没有谱库匹配,您也可以确信 MSn 质谱将为您提供可操作的结果。 | 在 mzCloud.org 上免费在线搜索,或通过 Thermo Scientific Compound Discoverer 和 Mass Frontier 软件包直接访问。不在线?mzVault 为您提供了执行离线谱库搜索的功能。 |
了解有关 mzCloud 质谱库的更多信息
了解高分辨率质谱库在应对小分子未知物质表征的挑战时可以带来的不同,以及强大的数据分析工具如何充分利用这些谱库,让您快速、可靠地找到答案,来推动您的决策过程。
mzCloud 是一款全面的高质量质谱碎片库,其中包含针对每个条目的大量谱图和元数据。每个条目还包括详尽的高分辨率 MS/MS 和多级 MSn 谱,这些谱是在各种碰撞能量下且使用不同裂解技术采集的。
每个原始质谱都经过过滤以去除噪音,经过重新校准以确保绝对质量精度,经过完全注释和整理以确保质量和一致性。
该谱库的内容每周更新,以便覆盖广泛的化学空间,确保与所有小分子应用领域的相关性。
Mass Frontier 软件利用 mzCloud 内容通过亚结构搜索来鉴定未知化合物的示例;比对 mzCloud 质谱数据库搜索实验碎片谱(左上),给定质谱树中显示的相应谱图匹配(中上),支持的谱图信息(左下)和匹配碎片谱中确定的母离子结构(右下),以及碎片来源的库化合物结构(右上)。
区分不同类型的数据库很重要,因为其内容和内容的质量通常有很大差异,这些可能会影响数据的可靠性以及所获结果的可靠性。
- 化学品数据库:化学品信息的集合,至少有名称和分子式。它还可能包括结构、元素组成、保留时间信息以及其他生物或化学元数据。
- 准确质量数(AM)数据库:AM 数据库包含准确质量分子式。
- 准确质量保留时间(AMRT)数据库:AMRT 数据库包含针对特定分析方法的准确质量和保留时间。
- 谱库:谱库是一个数据库(AM 或 AMRT),除上述数据库外,还包含化合物的参考质谱数据、MS/MS 和/或 MSn 数据。
mzCloud 质谱树示意图获得具有多重极性 (ESI +/-) 的给定化合物和一系列加合物的质谱图。使用不同裂解技术(CID、HCD)在多个碰撞能量下将每个母离子彻底打碎,在每个裂解级别(MS2、MS3、MS4等)下产生碎片谱图集合,进而为每个库条目生成综合信息质谱树。
mzCloud 是一款全面涵盖的质谱谱库,其内容基于广泛的化学空间(因此涵盖所有小分子应用领域),并使用 CID 和 HCD 在各种碰撞能量下,针对多种加合物获取高分辨率和准确质量数据。每种母离子都包含约10–20种碰撞能量;这种多级、多维 MSn 谱图数据会排列成质谱树,它们既广泛又全面,每种化合物通常包含成百上千个谱,许多都超过了 MS4 碎裂步骤。
每个库条目的大量数据对于准确识别化合物、将实验获得的数据与库内容数据相匹配以及 Compound Discoverer 和 Mass Frontier 数据分析软件实现适当置信度和数据可视化效果至关重要。Compound Discoverer 和 Mass Frontier 软件中的其他工具(包括 mzLogic)使用丰富的裂解信息可靠地鉴定不能仅根据谱库化合物条目来鉴定的未知化合物。
Mass Frontier 软件中可用的质谱内容整理工具示例。它包含手动整理 mzCloud 中所含内容的所有功能。mzCloud 的强大功能有赖于其内容的广度和高质量,有助于实现可靠的化合物鉴定。
尽管基于 Thermo Scientific Orbitrap 的质量分析器通常提供亚 ppm 级的质量精度,但是任何用于比对库进行搜索的实验数据都会有少量不准确性;如果库本身也包含有质量误差的数据,那么会加重这些误差。误差加重意味着更难做出任何鉴定或者由于匹配分数更高而使置信度更低。
整理 mzCloud 中的内容,可以防范与之比较数据的参考谱中的错误和差异。整理过程包括:
- 对多个单独采集的谱图取平均
- 去除质谱噪音
- 根据碎片离子元素组成的预测化学式重新校准质谱,该化学式基于母离子的已知元素组成和结构
- 注释具有碎片结构的所有碎片离子
- 附加大量元数据,包括数据源和所有原始数据文件
对每一个质谱都执行此整理过程——针对每种碰撞能量、每种碎裂类型、每种 MSn 水平和每种母离子。因此,mzCloud 中的谱图数据具有极高的质量,并且由于具有较高的控制水平,与众包谱库相比具有明显优势。
在 m/z 213.05462 时突出显示的峰上显示无误差的重新校准的碎片谱图,并且在每个碰撞能量下为每个谱、在每种 MSn 水平下为每种碎裂类型提供了所有注释。
使用 mzCloud、mzLogic 以及其他可用于 Compound Discoverer 软件和 Mass Frontier 软件的数据分析和质谱预测工具加速您的小分子未知物质鉴定研究。
只要您有互联网连接,您便可以通过 Compound Discoverer 和 Mass Frontier 软件包访问 mzCloud 中的内容。没有互联网?没有问题 – mzVault 为您提供离线格式的 mzCloud MS 和 MS/MS 内容。
由于安全问题或本地防火墙,并非所有人都能将处理数据的专用 PC 连接到互联网。考虑到这一点,mzCloud 的内容按每年两次的频率合并为离线版本。mzVault 软件应用程序会帮助您访问此信息。除了访问 mzCloud 离线版本,mzVault 应用程序还可以储存和搜索您的高质量定制内部(离线)MS/MS 谱库。
mzCloud 仍然可以为鉴定和表征未知物质提供卓越的解决方案,并让您能够使用 Compound Discoverer 软件和 Mass Frontier 软件中的多种工具。
即使是复杂样品导致出现与 mzCloud 中任何化合物都不匹配的完全未知物质,或者是可被鉴定的碎片太少而无法进行假定鉴定,在自定义库中储存此信息的功能也能让用户搜索数据,以便查看之前是否观察过该“未知 物质”,从而构建有用的信息库。Compound Discoverer 软件允许您将质谱数据发送至现有 mzVault,或创建新质谱数据,而 Mass Frontier 软件包含让创建的任何 mzVault 谱库达到 mzCloud 相同标准所需的整理工具。
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