通过扩展功能， 插件可提供一种管理所有其他应用和分析的强大方法。使用 Torrent Suite 和 Ion Reporter 软件时，您在每次运行结束时均可通过使用不同的插件自定义您的分析。多种 Ion 支持的插件（如变异检测和从头组装）可自动与 Torrent Suite 软件装配。此外，可用开源插件扩展功能。然而，这些插件尚未经过功能测试，因此未记录到支持内容中。我们 Connect 云端平台上的插件商店提供了完整的插件菜单。
Ion 支持的软件插件
已集成到软件中的插件
- ampliSeqRNA
- assemblerSPAdes
- coverageAnalysis
- DataExport
- ERCC_Analysis
- FieldSupport
- FileExporter
- FilterDuplicates
- immuneResponseRNA
- IonReporterUploader
- molecularCoverageAnalysis
- PGxAnalysis
- runTransfer
- sampleID
- variantCaller
可从 Connect 下载的插件
- AgriSum 工具包
- RNASeqAnalysis
- 用于 Torrent Suite 软件的 RNASeqAnalysis
- TRBVNovelAlleleDiscovery (Ion Reporter)
开源插件
- AmpliSeq 微生物组健康分析
- Methlation 分析
- MSI 调用
- 全细菌分析
- Partek Flow 上传器
- Pathogenomix Ripseq NGS
- SmallRNA 分析