蛋白质鉴定
大多数蛋白质组学应用均涉及使用液相色谱质谱 (LC-MS) 进行肽段测序。蛋白质被酶解消化为多肽成分，并通过 LC-MS 进行分析。产生的序列数据可用于测定样品的原始蛋白质成分。也可以采用这种方法获得有关翻译后修饰 (PTM) 和化学计量的信息。对于单个蛋白质，序列可以确认其特征和表征 PTM。对于蛋白质复合体，此方法可确定构成亚基和 PTM 的复杂化学计量的单个蛋白质的特征。
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质谱多肽测序
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大多数蛋白质组学应用均涉及使用液相色谱质谱 (LC-MS) 进行肽段测序。蛋白质被酶解消化为多肽成分，并通过 LC-MS 进行分析。产生的序列数据可用于测定样品的原始蛋白质成分。也可以采用这种方法获得有关翻译后修饰 (PTM) 和化学计量的信息。对于单个蛋白质，序列可以确认其特征和表征 PTM。对于蛋白质复合体，此方法可确定构成亚基和 PTM 的复杂化学计量的单个蛋白质的特征。